公司停薪留职是不合法的。目前国家出台的关于停薪留职的规定的前提是员工个人申请，经企业批准后申请人才会停薪留职。同时企业停薪留职人员与用人单位依然是劳动关系，受《中华人民共和国劳动法》的保护。如果说公司确实不景气的，是可以采取申请裁员的方法。

一、停薪留职五险一金谁负

停薪留职期间，不升级、不享受各种津贴、补贴和劳保福利待遇，停薪留职人员在从事其它有收入的劳动时，原则上应按月向原单位缴纳社会保险基金。

二、企业职工停薪留职官方规定

为了适应企业转换经营机制，配合深化劳动制度改革，现对企业职工停薪留职的有关问题通知如下：

（一）停薪留职的对象，主要是企业中富余人员、企业的科技人员、技术工人以及其他职工要求到我省城乡创办、领办企业特别是到乡镇企业、贫困地区从事科技开发、承包、兴办开发性企业的，也可以停薪留职。

（二）要求停薪留职的职工，应由本人提出书面申请，报所在单位批准。企业与批准停薪留职的职工应签订停薪留职合同，并报企业主管部门和企业所在地劳动部门备案。

合同由双方共同商定，其内容应当包括：停薪留职的期限（不超过三年）、停薪留职期间工资和劳保福利待遇的处理、工龄计算以及双方认为需要明确的其他事项等。

未经批准擅自离职的，所在单位按违反劳动纪律处理。

（三）停薪留职职工在合同期满后，仍回原单位复职，原单位无法安排的，可以按照省劳动局《关于进一步深化劳动制度改革，为企业安置部分富余人员的意见》（劳计字［1992］第161号）处理，如果原单位并入其他单位或已撤销的，由合并后的单位或原单位的上级主管部门安排，无法安排的，也按照省劳动局劳计字（92）第161号文件规定处理。

（四）对企业职工在停薪留职期间有关问题和处理规定如下：

1．工资待遇问题：在停薪留职期间停发工资、奖金和各种津贴、补贴（包括房贴）等，本人标准工资作为档案工资保留。

2．劳保福利待遇问题：职工在停薪留职期间，不享受原单位的各种福利待遇、劳保津贴和劳动保护用品。

3．工龄计算问题：职工在停薪留职期间，应按月向原单位缴纳退休养老基金、待业保险基金等，缴纳的可以计算连续工龄，不缴纳的不计算连续工龄。其缴纳的数额（含个人缴纳部分），不少于职工在停薪留职前月工资总额的25％，职工停薪留职期间或期满后回原单位工作符合退休年龄时，由原单位办理退休手续。

4．工伤事故处理问题：职工在停薪留职期间被聘用的，正常死亡或伤亡或发生伤亡事故，由聘用单位负责处理，造成丧失劳动能力或死亡的，其各项费用由聘用单位负责。

职工停薪留职后自谋职业的。如发生正常或意外伤亡事故的，一律作为非因工处理。其抚恤费用原单位按有关规定发给。

5．职工在停薪留职合同期满要求继续停薪留职的，应在合同期满前向原单位申请，经批准后续订停薪留职合同；如在合同期满后又未办续订手续的，15天内不回原单位报到的，原单位可以除名。

6．职工在停薪留职期间被司法机关送去劳动教养、被判刑的，原单位可以按辞退或开除处理。

（五）职工经企业批准停薪留职的，其在原企业的工资总额，可以由原企业留作工资储备金使用。

（六）职工在停薪留职期间要求调动工作的，原单位应当支持。如属于企业生产、经营需要的专业技术人才，必须双方协商，经企业同意的，主管部门或劳动部门方可办理调动手续。

（七）经批准停薪留职的职工，不得私自带走原单位的技术资料和技术成果，对私自带走技术资料或科研成果的，或因私自带走技术资料和科技成果给原单位造成经济损失的，职工和受益单位应当赔偿。

（八）经批准停薪留职的职工，不得私自带走原单位的工具设备特别是精密仪器，一经发现，由原单位视情节轻重，给予行政处分或送交当地司法部门处理。

（九）对批准停薪留职的职工，原单位应当帮助安置好他们的家属生活，如住房、子女上学等，不能歧视。

（十）执行停薪留职合同中发生争议，由双方协商解决，协商无效的，由当地劳动行政部门的仲裁机构协调处理。

（十一）本通知不适用于劳动合同制工人。

（十二）国家机关、事业单位的工人停薪留职可参照本规定办理。

（十三）本规定自发文之日起执行。