1、通过扣缴义务人申报其实就是指通过纳税单位来进行申报，一般一些工薪族都会选择通过扣缴义务人来进行申报。单位在给职工发放工资时会直接扣除还有个人所得税两项费用，如果人没有向单位申报专项附加扣除信息，那么单位在计算职工个人所得税费时，就会统一按照5000元起征点的标准来计税，但是如果纳税人将填写的个人所得税专项附加扣除信息表申报给了单位，那么单位就知道了职工专项附加扣除的信息了，单位每月在计算职工个人所得税时，就会按照专项附加扣除标准来抵扣，这种方式对于职工来说，比较方便，职工第二年不用自己到税务部门办理汇总清缴了，单位每月在发放工资时，就自动将专项部分进行扣除了。

2、对于不愿意将个人信息提交给单位的用户可以选择综合所得年度自行申报。自行申报的意思就是纳税人自行将申报信息递交到当地的税务部门，不经手单位，这种情况，个人所得税专项附近扣除部分的税费每月不会进行抵扣，单位仍然是按照5000元起征点的标准来给职工计税的，纳税人到了第二年的时候，需要自行去当地的税务部门办理税费汇总清缴。