(一)部分稽查人员业务素质不高。税务稽查人员重视税法而忽视了会计法，从而影响查账水平；忽视税收相关程序性法律，往往偏重于查账技巧的学习研究，缺乏对《行政复议法》、《行政诉讼法》、《行政处罚法》、《刑法》以及相关司法解释的系统学习，导致稽查人员取证不足、违法取证、越权取证，或取得的证据经不起复议或诉讼的考验，从而导致税务处理决定被撤销或行政诉讼败诉。

(二)部分稽查人员法纪观念不强。法纪观念淡薄、职业道德水平不高和价值观念错位，将直接导致税务稽查人员放松思想警惕，忽视世界观改造，成为导致税务稽查风险最根本的动因。作为税务稽查人员，如果不能摆正自己的位置，经受不住种种诱惑甚至以身试法，将大大增加税务稽查风险。

(三)部分纳税人依法纳税意识淡薄。受传统税收文化和社会不良风气的影响，部分纳税人依法纳税意识薄弱。为了达到少缴税或不缴税的目的，极力对税负避重就轻，在财务账、证上做文章。面对税务检查则可能通过非法途径逃避、抵制，如找关系、行贿、威胁、暴力抗税等，客观上促使税务稽查人员走上违法违纪之路。

(四)税务稽查有效监管制度缺失。税务稽查部门缺乏执法监督的有效监管制度，缺乏守法守纪的制度环境和人文环境，上级监督太远，同级监督太软，社会监督太浅，对违法违纪情况惩罚不力，对守法守纪表率表彰不够，日常宣传和培训教育不足，加上市场经济带来的诱惑和个人缺乏思想修炼，以致少数干部出现世界观、人生观、价值观蜕变，成为个别稽查人员违法违纪的重要诱因。

(五)行政干预导致稽查人员无所适从。由于“官本位”思想的影响，税收法治与人治并存的局面仍然客观存在。个别行政领导特权意识很强，在缺乏有效监督制约和行政伦理失范的情况下，他们常常以招商引资、优化环境等为由，或者对重点纳税户采取保护政策，或者为亲友说情，干预税务稽查执法，致使税务稽查人员工作被动，无所适从，无法正常行使稽查权利。由此造成的风险，成为税务稽查风险的重大隐患。以补代罚、以罚代刑等情形的出现，除了税务系统内部利益因素驱使以外，主要还是受外界力量特别是行政力量干预所致。