一、民法典股权转让协议是否有效

民法典股权转让协议是有效，只要当事人符合一定的条件，包括当事人有民事行为能力，是真实意思表示，不违反法律强制性规定和公序良俗的，具有法律效力。

《中华人民共和国民法典》

第一百四十三条具备下列条件的民事法律行为有效：

1.行为人具有相应的民事行为能力;

2.意思表示真实;

3.不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。

二、股权转让协议纠纷是否有诉讼时效

根据《民法典》第一百八十八条，股权转让协议是有时效规定的，如果因股权转让协议产生纠纷的，诉讼的时效为三年；如果因股权收购协议产生纠纷的，起诉时效为股东会会议决议通过之日起九十日内。

股权转让协议有效期从签署股权转让协议开始到股权转让协议结束。

有限责任公司股东履行出资义务是依据公司章程履行合同义务，未履行或未完全履行出资义务属于违约行为，其他股东有权对其提起要求补足出资的诉讼。诉讼时效期间应当依据公司章程规定的出资时间起计算，诉讼时效为三年。

三、民法典规定股权转让协议无效但已实际履行如何处理

民法典规定股权转让协议无效但已实际履行处理如下：

1.行为人因该合同取得的财产，应当予以返还；

2.不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。

3.各方都有过错的，应当各自承担相应的责任；

4.一方有过错的，过错方应当赔偿对方由此所受到的损失。