建设工程结算纠纷内在诱因建设资金准备不足或资金被挪用。在资金方面，施工前期，承包方为了尽可能地揽到工程，会提出一些优惠条件，并满足一些对方苛刻的条件，如带资或垫资承包，到竣工办理结算时，会提出利息或耽误工期等问题，从而引发结算纠纷。

另外基本建设项目开工的前提条件是三通一平，一般合同条件下，三通一平的费用已包含在报价中，业主负责外围协助，主要工作内容由承包商负责完成，特殊环境下可能分包出去，比如进场道路过长且业主对此有明确等级要求，现场钻井时地下水层过深，岩石等级过高等。假如建设施工业主没按合同规定按时提交设计资料、图纸、没有及时交付施工场地，没有做到开工前的三通一平，或工程地质与合同不符。往往会引发三通一平结算审核的各种问题，在结算时引发各种纠纷。