拆迁纠纷法院不能冻结房产，法院可以查封房产，但不是冻结房产。法院查封房产的情形如下：

(1)恶意转移或者变卖房产；

(2)诉前保全；

(3)执行案件时，暂时没有履行能力或没有其他可供执行的财产。

一、法院查封房产的流程是什么样的

依照现行相关法律的规定，一般是在提起财产保全或者强制执行的程序时，人民法院将有可能会对房产查封。手续如下：

(1)法院会向国土房产部门发出《协助执行通知书》以及附带的法律文书；

(2)办案人员向国土房产部门出示法院工作证，并根据下列的不同情形办理查封手续：

A、被查封的标的物已经核发过房地产证的，应上交国土房产局档案室出具的查册表；

B、被查封的标的物是预售的商品房的，应提交房地产交易所出具的该预售商品房的交易情况表或该楼盘的明细表；

C、被查封的标的物是土地的，应先到国土房产局档案室查清该土地权属情况，并提交查册的书面结果。

(3)国土房产部门根据法院提交的资料，进行查封处理。

二、法院查封房产，但未告知登记机关，发生争议时如何处理

法院查封房产，但不告知登记机关的极为少见。即使不告知登记机关，如果被执行人不对被查封的房产进行处分，也不会有争议产生。即便有争议产生，如果登记机关没有为被执行人办理处分该房产的权属登记，争议也不会涉及登记机关。因而，这种争议的产生应同时具备以下3个条件：一是法院未将法律文书送达登记机关；二是被执行人违法处分房产；三是登记机关为其办理了权属登记。