公司把打卡记录删除不是违法行为，但是若是有劳动仲裁，则打卡记录属于公司应当提供的证据，公司应当承担因此产生的不利后果。根据相关法律规定，用人单位应当按照劳动合同的约定履行义务。

一、公司主管辞退员工公司不承认怎么办

部门主管辞退员工公司不承认，员工可以收集证据申请劳动仲裁。例如工作证或工作牌（最好盖有公章）、工资卡交易记录、工资条、有公司名称的工装、去地税局打印并盖章的个税完税证明、用人单位办理的暂住证、考勤记录、社会保险缴纳记录、派工单、同事证言（离职在职的都可以）、录音录像或者其它有自己名字和公章或老板签字的的书面材料等。员工被辞退,单位不承认,那么员工可以申请劳动仲裁进行索赔。如果单位不能提供证据证明员工非被辞退,那么单位将承担不利后果。

二、没有劳动合同老板拖欠工资怎么办?

没有与老板签订合同，老板拖欠工资的，可以向劳动监察大队举报，劳动行政部门应当责令用人单位支付劳动者拖欠的工资。如果用人单位仍然不支付的，可以收集能够证明存在劳动关系的证据（工作证、打卡记录等）向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁。

三、申请劳动仲裁应当提交哪些资料

当事人申请劳动仲裁应当提交下列文件：劳动仲裁申请书、申请人与被申请人存在劳动关系的证明材料、证据资料：如劳动合同或协议、工资单、工牌、上班打卡记录、同事的证人证言等、劳动者的身份证复印件以及用人单位的工商资料。