利用注销企业公章签署拆迁协议是不合法的。企业注销是指公司注销，公司宣布破产，被其他公司收购，规定的营业期限没有到期，或者公司内部解散等情况下，公司需要向注册机构申请注销，中止公司法人资格的过程。同时，公司注销后，公司印鉴也应回收，销毁。因此，公司注销后，公司法人消失，公司也不存在。此时，用这个注销企业的印鉴签订撤销协议当然没有法律效力。

公章如何销毁

公章停止使用后，使用单位应当在十日内，将印章全部交回上级主管部门，或登记管理机关封存。逾期不交的，由上级主管部门或登记管理机关予以收缴。上级主管部门或登记管理机关对交回和收缴的印章要登记造册，并于十日内送备案或批准刻制的公安机关。公安机关对交回和收缴的印章，需预存两年，无特殊情况的，预存期满后予以销毁。

《中华人民共和国公司法》第一百八十八条公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。

《中华人民共和国公司法》第一百八十二条公司经营管理发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，通过其他途径不能解决的，持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，可以请求人民法院解散公司。