一、拖欠工程款的违约金计算方式

当计算拖欠工程款的违约金时，可以从以下三个方面进行考虑：

（一）违约责任取决于合同约定和法律规定，且约定优先。

（二）违约金有约定按约定，没有约定的，参照实际损失计算。

（三）当事人没有约定利息而约定了迟延付款违约金的情况下如何处理。

所以，合同中约定违约责任并明确违约金具体数额的，从其约定;如果没有约定，按照法律规定处理，收取定金一方违约的，双倍返还定金。双方都有过错的，按照各自过错程度分担。违约金不足以弥补损失的，可以要求违约方按对方所受损失进行赔偿;违约金过高的也可以请求减少赔偿金额。

二、合同违约金如何约定才合法

约定违约金属于当事人意思自治的产物。当事人是否约定违约金及是约定具体违约金额还是约定违约计算方法法律原则上不加以禁止。但为稳定社会秩序，防范金融风险，违约金又要受到公平原则和诚实信用原则的限制。因此，确定违约金时，既要权衡双方对违约金的约定体现惩罚性质，又要通盘考虑违约所造成损失彰显赔偿功能。故通说认为，我国违约金兼有赔偿性和惩罚性的双重属性，赔偿性体现了违约金的基本功能，惩罚性体现了违约金的特殊功能。

由于约定违约金具备双重功能，故在具体案件中确定约定金时，应严格依照《民法典》第585条规定处理，即当事人约定的违约金低于造成的损失，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。针对何为“过分高于”，即约定违约金不得超过造成损失的30%。

三、拖欠工程款起诉时间

工程验收合格后的3年内起诉有效.根据《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》第6条规定“未约定履行期限的合同，依照《民法典》的规定，可以确定履行期限的，诉讼时效期间从履行期限届满之日起计算。”

拖欠太久的工程款，承包商经常因法律意识淡薄或碍于情面怕影响与建设方的关系等原因而错过诉讼时效。在此有必要提醒：工程欠款的诉讼时效为两年，从知道或应当知道拖欠行为起算。我国法律规定诉讼时效可以通过一定的主张权利行为得以中断，中断后诉讼时效可以重新计算。