一、如何保障自己在签署三方协议后的合法权益

1．协商。指合同纠纷的当事人，在自愿互谅的基础上，通过摆事实、讲道理，达成和解协议，自行解决合同纠纷。

2．调解。合同纠纷的调解，是指双方当事人自愿在第三者的主持下由第三者进行说明劝导，促使他们互谅互让，达成和解协议解决纠纷。

3．仲裁。合同仲裁，即由第三者依据双方当事人在合同中订立的仲裁条款或自愿达成的仲裁协议，按照法律规定对合同争议事项进行居中裁断。

4．诉讼。诉讼是解决合同纠纷的最终形式。所谓诉讼是法院根据合同当事人的请求，在所有诉讼参与人的参加下，审理和解决合同争议的活动。

二、劳动合同和三方协议有哪些区别

1．签订时间不同：

三方协议：应在毕业生就业之前签订。

劳动合同：在毕业生到用人单位报到后才签订。

2．主体不同：

三方协议：适用于应届毕业生与用人单位、学校三方之间，学校是就业协议的鉴证方或签约方，就业协议对用人单位的性质没有规定，适用任何单位；

劳动合同：只适用于劳动者（含应届毕业生）与用人单位（不含公务员单位和比照实行公务员制度的组织和社会团体以及军队系统）之间，与学校无关。

3．内容不同：

三方协议：内容主要是毕业生如实介绍自身情况，并表示愿意到用人单位就业、用人单位表示愿意接受毕业生，学校同意推荐毕业生并列入就业方案，而不涉及毕业生到用人单位报到后应享有的权利义务。

劳动合同：主要内容涉及劳动报酬、劳动保护、工作内容、劳动纪律等方方面面，劳动权利义务更为明确。

4．目的不同：

三方协议：是毕业生和用人单位关于将来就业意向的初步约定，是编制毕业生就业方案和将来双方订立劳动合同的依据。

劳动合同：主要是劳动关系确立后使劳动者和用人单位的合法权益得到应有的保障。

5．适用的法律不同：

三方协议：制定、发生争议后的解决主要依据是《国家关于高校毕业生就业的规定》、《民法典》等。

劳动合同：订立以及发生争议后主要是依据《劳动法》和《劳动合同法》来解决。

三、签了三方协议可以辞职吗

与用人单位签了三方协议，是可以辞职的，三方协议是《普通高等学校毕业生、毕业研究生就业协议书》的简称，它是明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式，能解决应届毕业生户籍、档案、保险、公积金等一系列相关问题。

三方协议在毕业生到单位报到（凭《全国普通高等学校本专科毕业生就业报到证》或《全国毕业生研究生报到证》）、用人单位正式接收后自行终止。也就是说实习期满之后，你若是不想继续在该用人单位工作，可以随时离开。