虽然当事人可以自由选择以上方式确定股权转让价格，但仍需遵守我国法律的强制性规定。如果股权转让价格与股权实际价值（或市场价值）差距过大，往往容易产生股权特让纠纷，有异议的一方可能会以此为由主张股权转让双方恶意串通。而依据我国《民法典》的相关规定，恶意串通约定股权转让价格，致国家、集体或者第三人利益受损的，将导致股权转让行为无效为了避免此类法律风险，保障股权转让各方的合法权益，当事人应尽量采取反映股权实际价值或市场价值的价格确定方式。例如。可以先对公司的资产、负债情况进行整体评估、审计，确定转让基准价格，并以此为基础协商确定转让价格，还可以结合公司不良资产率、国家产业政策等因素确定转让价格，或者引进拍卖、变卖的市场竞争机制转让股权。

一、确定股权转让价格应注意哪些问题

确定股权转让价格应注意以下问题：

（一）采用综合评估确定股权转让的基准价格；

（二）引入市场机制转让股权。

二、确定股权转让价格时应注意的问题

（一）股权转让协议是否必须约定股权转让的价格？

不是。股权转让除了以交易的方式实现，也可以赠与的方式实现，因此股权转让协议并不一定要约定股权转让的价格。而且，即使是以交易方式实现股权转让的协议也可以约定由补充协议来确定股权转让价格。

不过必须要注意的是，赠与合同的赠与人具有任意撤销权，加上《民法典》规定“赠与的财产依法需要办理登记等手续的，应当办理有关手续”，以赠与方式转让股权的，合同约定的权利义务并不稳固。

（二）股权转让的价格是否需要与出资额相同？

如果公司发展良好，其股权转让价格一般高于股权对应的出资额，如果公司连年亏损，则有可能低于出资额。事实上，股份有限公司的股权在证券交易所内交易，其价格明显与出资额并无绝对关系。

（三）哪些属于股权转让价格低于成本的合理理由？

《国家税务总局关于股权转让所得个人所得税计税依据核定问题的公告》明确以下是股权转让价格低于成本的合理理由：

1、所投资企业连续三年以上（含三年）亏损；

2、因国家政策调整的原因而低价转让股权；

3、将股权转让给配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹以及对转让人承担直接抚养或者赡养义务的抚养人或者赡养人；

4、经主管税务机关认定的其他合理情形。