1、检察机关是会根据实际的情况来退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。

2、如果两次补充侦查后，仍然证据不足的，检察院认为不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。值得注意的是，对于补充侦查的案件，按规定需要在一个月以内补充侦查完毕。

交通违法处罚案卷保管期限

行政处罚档案保存年限为永久保存。主要依据为根据《档案法》及《公安档案管理限定》第八条四项的限定：搜罗保管具有永久保存价值的公安档案、资料，并自形成之日起满20年即向同级公安档案馆移交；同级未设公安档案馆的向上一级公安档案馆移交。移交后做永久保存，也就是最少不低于60年。

行政处罚是指行政机关或其他行政主体依法定职权和流程对违背行政法规尚未构成犯罪的相对人予以行政制裁的具体行政做法。行政处罚的前提是相另一方实施了违背法律规范的做法，而非违背了刑法、民法等其它法律规范的做法

《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条

人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。

人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。

对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。

对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。