同居子女抚养纠纷的法院处理原则是：平等原则、合法原则、最有利于未成年子女的原则等。非婚生子女享有与婚生子女同等的权利，不满两周岁的非婚生子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的且父母无法协商的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。

同居子女抚养问题如何处理？

1、未办理结婚登记手续，在同居期间生下的子女属非婚生子女。

2、对非婚生子女的抚养问题，原则上男女双方协商，由谁抚养。

3、协商不成，可以直接向人民法院起诉，由法院根据实际情况作出判决。

4、不抚养方承担相应的抚养费，直至子女能独立生活为止。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十一条

非婚生子女享有与婚生子女同等的权利，任何组织或者个人不得加以危害和歧视。

不直接抚养非婚生子女的生父或者生母，应当负担未成年子女或者不能独立生活的成年子女的抚养费。

第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。