调解协议可以确认合同效力纠纷，存在合同效力纠纷的合同当事人如果不能协商一致，可以要求有关机构调解如，一方或双方是国有企业的，可以要求上级机关进行调解。上级机关应在平等的基础上分清是非进行调解，而不能进行行政干预。当事人还可以要求合同管理机关、仲裁机构、法庭等进行调解。

一、通过起诉的方式来确认合同效力纠纷的流程

1、人民法院审理民事案件，除涉及国家秘密、个人隐私或者法律另有规定的以外，实行公开审理。对决定开庭审理的案件，将在开庭三日前通知双方当事人。

2、开庭审理大致分为法庭调查、法庭辩论和评议，宣判等几个阶段。如果您提出回避申请，需要说明理由。如果不提出申请或者申请被驳回，庭审将继续进行。

3、在法庭调查阶段，审判长或审判员将组织双方当事人，针对自己的请求和主张，按顺序分别举证、质证。质证是当事人围绕证据的真实性、关联性、合法性、针对证据有无证明力以及证明力大小，进行质疑、说明和辩驳。

4、在法庭辩论阶段，审判长或审判员将组织双方当事人针对争议焦点，围绕全案事实、法律责任等发表意见。

5、在评议、宣判阶段，合议庭或审判员将对庭审情况进行总结，对双方当事人发表的意见进行评议，表明是否予以支持，并阐明理由。

6、如果您是原告，经法院传票传唤无正当理由拒不到庭的，法院可以按撤诉处理；被告反诉的可以缺席判决。

7、作为当事人，在宣判前任何诉讼阶段，您都可以同对方当事人进行和解，或者请求人民法院主持调解。如果不同意调解或未达成调解协议，人民法院将继续审理并作出判决。