员工出差补贴不需要缴纳个人所得税。根据中华人民共和国国家税务总局关于印发《关于征收个人所得税若干问题的规定》的通知（国税发〔1994〕89号），（二）下列不属于工资、薪金性质的补贴。津贴或者不属于纳税人自己的工资。薪金所得项目收入不征税：1。独生子女补贴；2、公务员工资制度未纳入基本工资总额的补贴。津贴差额和家属副食品补贴；3、托儿补贴；4、差旅费津贴和误餐补贴。因此，在当地规定的标准范围内取得的差旅费津贴不征收个人所得税，超过标准部分并入当月工资薪金计算缴纳个人所得税。

出差补贴能代替加班工资吗

节假日本就是劳动者休息的时间，这时候被占用工作的话，企业应当给予员工调休或是现金补助。不要以为用加班或者出差津贴就能代替加班费，要知道这完全是两个不同的概念，用人单位不能混为一谈。

而关于出差给予加班费的问题，应该分两种情况来考虑。

若该双休日劳动者提供了劳动，用人单位能够安排补休的，给予同等时间的补休，不发加班工资；确实不能补休的，用人单位应按照《劳动法》的该项规定的标准发给加班工资；

若该公休日劳动者并未提供劳动，只不过是在出差地休息，这种情况下，劳动者不是加班，用人单位不需要另外支付加班工资。

也就是说，如果劳动者出差属于加班，单位应按规定给付加班费，不能用出差补贴来代替。

涉外税务检查规程