WTO争端解决的操作过程不仅涉及争端的各方，还涉及发挥特定职能的其他方。

WTO总理事会通过争端解决机构（DSB）来承担解决争端的责任。WTO所有成员的贸易代表都有权加入争端解决机构（DSB），DSB的首要任务是监督WTO条件下争端解决的执行；

其次，成立争端解决专家小组；采纳专家小组或上诉机构的报告；以及，在当事一方未能履行专家报告决定时，授权另一当事方终止让步。专家小组和上诉机构属于负责裁决争端的实体。专家小组报告常常会被诉诸上诉机构。专家小组由特殊情况下召集而成的专家组成。

上诉机构则是一个常驻团体，它由7名贸易问题专家和贸易法律专家组成，上诉机构负责审议专家小组提交的报告的合法性。