可以约定两个法院。协议管辖中约定的管辖法院只要符合法律规定的范围，且不违法级别管辖、专属管辖，则约定的管辖法院数量不影响管辖协议的效力，管辖协议约定两个以上与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，原告可以向其中一个人民法院起诉。所以可以约定两个，但是最终只能选择向其中一个法院起诉。

运输合同管辖法院能否约定

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二十七条的规定，因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖。运输合同纠纷是可以约定管辖法院的，但只能在运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院之间约定一个管辖法院。

《最高人民法院关于适用＜中华人民共和国民事诉讼法＞的解释》第三十条：根据管辖协议，起诉时能够确定管辖法院的，从其约定；不能确定的，依照民事诉讼法的相关规定确定管辖。管辖协议约定两个以上与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，原告可以向其中一个人民法院起诉。