当前，我国医疗保障制度建设进入了新的历史阶段，一些深层次的矛盾和困难逐渐凸显出来。如何加快城乡统筹步伐，进一步理顺体制、创新机制、完善制度，实现保障公平、运行稳健、发展永续，是需要深入研究和认真解决的重大课题。

调研发现，城镇居民基本医疗保险与新型农村合作医疗(以下简称新农合)由于制度分设、管理分离、资源分散，不但提升了管理成本，降低了管理效率，给城乡居民带来诸多不便，而且固化了城乡二元结构，对实现公平正义、促进社会和谐造成了严重障碍和负面影响，突出表现为三个不利于和三个重复。

三个不利于：一是不利于体现社会公平。城乡医疗保险制度分设，使广大居民只能根据户籍身份被动加入相应的保障制度，强化了城乡户籍观念，固化了二元社会结构，不能很好地体现社会保险的公平性。二是不利于人力资源的流动。随着我国城镇化快速推进，人力资源在城乡间的流动加快，城乡医疗保险制度不贯通、信息不共享、管理不统一，造成这些流动的从业人员医疗保险关系难以接续，待遇无法衔接，农民工在城乡之间流动时医保关系转移接续尤为困难。三是不利于医疗保险制度的可持续发展。城乡医疗保险制度分别由不同部门管理和经办，无法统筹谋划各项保险制度的长远发展，无法统一、科学评估制度运行的真实绩效，增加了体制成本，造成了社会资源的严重浪费。

三个重复：一是居民重复参保。当前，职工医保、居民医保由人力资源社会保障部门管理，新农合由卫生部门管理，由于管理方式和信息系统的不统一，信息不能共享，实际工作中又存在互争参保资源的问题，导致各地普遍存在着城乡居民重复参保的现象。特别是农民工、乡镇企业职工、在城镇就读的农村学生、被征地农民等人群的重复参保问题非常突出。天津、成都、厦门、泰州整合医疗保险管理资源后，通过信息系统比对，分别发现有45万、27万、8万、20万人重复参保；南京市栖霞区11万城镇居民参保人员中，就有4万人同时又参加了新农合。二是财政重复补贴。据已经实行城乡统一管理地区的典型分析和大致推算，重复参保的比例约占城乡居民参保人数的10%左右。按今年城乡参保居民人均财政补贴120元计算，财政将为约1亿参保居民重复补贴120亿元，明显增加了各级财政的不合理负担。三是重复建立经办机构和信息系统。经过十多年的努力，城镇医疗保险经办机构的信息系统已经基本完善，如果新农合再设立一套经办机构和信息系统，势必增加管理成本，降低管理效率，浪费大量财政资金。据厦门等城市财政局估计，假如参照城市医疗保险信息系统建设新农合信息系统，需要再投入约6000至8000万元(不包括每年的维护费用)。全国是一个多么大的费用，可想而知！

如何解决三个不利于和三个重复的问题，实现基本医疗保障制度的全面协调可持续发展呢？中央指明了方向，《关于深化医药卫生体制改革的意见》(中发[2009]6号)指出，要有效整合基本医疗保险经办资源，逐步实现城乡基本医疗保险行政管理的统一。为贯彻落实中央医改文件要求，彻底解决三个不利于和三个重复的问题，不少地方已经开展了积极探索。例如：广东省从2004年开始探索医疗保险城乡统筹，是全国推进速度最快的省市之一。全省21个地级市中，已经有深圳、珠海、东莞等10个市开展医疗保险城乡统筹探索，清远、阳江、梅州等市政府已经决定将新农合移交社保部门统一管理。福建省明确了人力资源社会保障厅统筹城乡医疗保障工作的职能，要求新农合信息系统依托职工医保信息系统，省政府每年拿出200万元专项经费对开展医疗保险城乡统筹的地区进行奖励。目前，厦门市和邵武、上杭等20多个县实现了医疗保险城乡统筹。福州市政府常务会议决定，积极创造条件将新农合移交社保部门管理。江苏省无锡、镇江、苏州、常州、泰州等城市积极开展城乡统筹的探索，各城市都十分注重制度衔接，出台了转移接续办法；同步提高医疗保险统筹层次，提高基金共济能力。四川省成都、乐山、广元苍溪等城市都对医疗保险城乡统筹进行了积极探索。据有关部门统计，目前已全面开展医疗保险城乡统筹的地区有天津、重庆和宁夏3个省级行政区、21个地级城市和103个县(区市)。这些地区除浙江嘉兴和33县(区、市)城乡居民医疗保险由卫生部门统一管理外(职工医保仍由社保部门管理)，其余地区均由社保部门统一管理。