1.公安机关调查，遇到不明身份人的强拆，首先应报警。由公安机关进行调查，公安机关会出具调查结果，根据调查结果可以明确强拆房屋的行政机关。若强拆发生后，当事人报警或向公安机关提交立案查处申请书，公安机关怠于履行职责，可以向法院起诉确认公安机关不作为的行为违法，同时责令公安机关继续履行。在部分案件中，公安机关在强拆主体的确定上发挥了一定的作用。

2.当事人自行收集证据，在当事人收集的证据中很难有直接证据可以单独确定强拆主体，往往需要辅之以其他文书证据。这是因为一方面当事人收集到的证据本身存在瑕疵，照片无法辨认具体的拆迁人，政府机关会委托机构或者公司去实施强拆，难以举证这两主体之间的关联。其次是当事人存在举证困难，房屋强拆时当事人会遇到各方阻碍，并无条件充分及时的收集证据。

3.法院推定强拆主体，在被强拆人未报警以及证据不足以证明是具体行政机关所为时，为减轻被强拆人的举证责任，法院会进行推定，市、县人民政府是土地征收的主体，在被强拆人因为行政机关的违法行为举证不能时，根据市县政府发布的征收公告，行政机关对其行政行为的合法性承担举证责任，因此市县人民政府应提供证据证明其未实施强拆行为，若不能证明，法院会推定征收主体即是强拆主体。

提起诉讼需要有明确的被告。说明原告在起诉状中不仅要明确被告行政机关具体的名称，还要有初步证据证明该行政机关实施了该行政行为。明确的被告并不等于正确，但是被告明确法院才会立案。