公司的注销股东不配合的处理方法如下：

1、通过联合公司持股比例达到三分之二以上的股东人员召开股东会议进行投票表决是否同意注销公司。都是需要公司所有股东的三分之二及以上的人员通过才可以强行执行；

2、可以通过持有公司全部股权及表决权百分之十以上的股东去法院提出申请，可以请求人民法院解散公司。

公司注销的流程如下：

1、清算，注销登记；

2、核查是否有未缴清社保费用，然后注销公司社保账号；

3、核查是否有未缴清税款或费用，然后注销公司的国、地税；

4、公司需自行登报公示，宣告公司即将注销；

5、办理公司注销备案，注销营业执照。

公司注销的材料如下：

1、公司营业执照正副本原件及副本复印件；

2、公司股东会决议；

3、委托代理人证明；

4、注销申请书；

5、公章。

法律依据：《中华人民共和国公司法》第一百八十二条

【请求法院解散公司】公司经营管理发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，通过其他途径不能解决的，持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，可以请求人民法院解散公司。

股东不配合注销公司怎么处理

股东不配合注销公司没有影响。一个股东不配合不影响总的趋势，公司经营管理发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，通过其他途径不能解决的，持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，可以请求人民法院解散公司。公司财产在分别支付清算费用、职工的工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。

注销公司需要法人到国税拿表格，按国税的要求填写、签字、盖章、缴销发票、补税，收回地税税务登记证，领取一张地税注销税务登记通知书，到开户银行办理银行账户销户，法人拿着国税、地税、银行销户的证明到公司主管工商局办理，选择当地一家主流报纸，刊登注销公告，登报45日后，法人再次到工商局办理注销申请，到质监局注销代码证。

法律依据：《中华人民共和国公司法》第一百八十八条

公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。