新生儿死亡申请医疗事故鉴定的流程如下。首先由医疗机构或者医疗事故争议当事人，向卫生行政部门提出要求处理医疗事故争议的申请。然后对需要进行医疗事故技术鉴定的，交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织进行鉴定。法律规定医疗事故技术鉴定，可以收取鉴定费用。经鉴定，属于医疗事故的，鉴定费用由医疗机构支付；不属于医疗事故的，鉴定费用由提出医疗事故处理申请的一方支付。

医疗事故新生儿死亡赔偿标准

1．医疗费赔偿金额＝已发生医疗费用（不含原发病医疗费用）＋预期医疗费用

2．误工费赔偿金额＝误工时间收入标准（患者因误工减少的固定收入）

3．住院伙食补助费＝住院时间医疗事故发生地国家机关一般工作人员的出差伙食补助标准

4．陪护费赔偿金额＝陪护天数陪护人数医疗事故发生地上一年度职工年平均工资

5．伤残生活补助费赔偿＝伤残等级医疗事故发生地的居民年平均生活费赔偿期限

6．残疾用具费赔偿金额＝普及型器具的费用

7．丧葬费赔偿金额＝本市上年度职工月平均工资6个月

8．被抚养人生活费赔偿金额＝被抚养人的人数当地居民最低生活保障标准抚养年限

9．交通费赔偿金额＝实际必需的交通费用单据数额之和

10．住宿费赔偿金额＝住宿天数医疗事故发生地国家机关一般工作人员的出差住宿补助标准

11．精神损害抚恤金赔偿金额＝医疗事故发生地居民年平均生活费年限（死亡最长不超过6年，残疾最长不超过3年）

《医疗事故处理条例》第二十条卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者医疗事故争议当事人要求处理医疗事故争议的申请后，对需要进行医疗事故技术鉴定的，应当交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定；医患双方协商解决医疗事故争议，需要进行医疗事故技术鉴定的，由双方当事人共同委托负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。