事实婚姻关系的子女上户口跟非婚生子女上户口是一样的。父母到户籍所在地携带相关的身份证件和缴费证明，到孩子父亲或母亲常住户口所在地的派出所申请登记，假如没有医学证明，孩子母亲要持派出所出具的亲子鉴定委托，持亲子鉴定书到派出所办理出生登记。

非婚生子女如何上户口

根据相关政策规定，对于不符合计划生育政策的无户口人员，即政策外生育、非婚生育的无户口人员，本人或者其监护人可以凭《出生医学证明》和父母一方的居民户口簿、结婚证或者非婚生育说明，按照随父随母落户自愿的政策，申请办理常住户口登记。申请随父落户的非婚生育无户口人员，需一并提供具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定证明。

法律依据：

国务院办公厅《关于解决无户口人员登记户口问题的意见》（国办发〔2015〕96号）

不符合计划生育政策的无户口人员。政策外生育、非婚生育的无户口人员，本人或者其监护人可以凭《出生医学证明》和父母一方的居民户口簿、结婚证或者非婚生育说明，按照随父随母落户自愿的政策，申请办理常住户口登记。申请随父落户的非婚生育无户口人员，需一并提供具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定证明。

《户口登记条例》第七条

婴儿出生后一个月以内，由户主、亲属、抚养人或者邻居向婴儿常住地户口登记机关申报出生登记。弃婴，由收养人或者育婴机关向户口登记机关申报出生登记。