集体建设用地无产权厂房征收需要支付征地补偿。征地补偿协议需要由政府机关根据所征地段的具体情况(包括经济发展水平、工资收入情况等等)，结合被征地方的意见建议而制定的双方达成一致意见的补偿协议，需要注意的是，所征地地段的双方必须都要一致，并且在法律规定的范围之内进行签订，避免造成征地纠纷。

一、征地纠纷怎么处理？

1、针对集体土地的征地纠纷，如果被征收人对征地方案有意见，应当依据我国相关法律的规定，在经过征地前的告知、听证、征地公告发布及补偿安置方案发布后公告期内及时提出意见，并要求举行听证，如果经过上述程序救济之后，仍对补偿安置方案有异议，应当向县级以上地方人民政府申请协调；协调不成的，由批准征收土地的人民政府裁决。如果裁决后仍不服，可以申请行政复议或行政诉讼。

2、针对国有土地的征地纠纷，首先征地机关在征求公众意见的时候，被征收人就应当针对有异议的部分充分发表自己的意见，在征地机关作出征收决定发布公告期间，如果对征收决定有异议，可以依法提起行政复议或行政诉讼，如果仍未能达成补偿安置协议，发布征收决定的市、县级人民政府可以依据征收补偿方案向被征收人作出补偿决定，并在房屋征收范围内予以公告，针对上述补偿决定，被征收人仍有权提起行政复议或行政诉讼，被征收人在法定期限内不申请行政复议或者不提起行政诉讼，在补偿决定规定的期限内又不搬迁的，由作出房屋征收决定的市、县级人民政府可以依法申请人民法院强制执行。