一、厂区违章建筑归什么部门管

违章建筑的认定是由县级以上人民政府土地行政主管部门负责的，现实情况中一般是由住建部门和市政管理部门负责的。具体依据《中华人民共和国土地管理法》规定如下：第七十四条占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等，破坏种植条件的，或者因开发土地造成土地荒漠化、盐渍化的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令限期改正或者治理，可以并处罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

二、违章建筑应该由哪个部门来认定

违章建筑的认定部门是规划部门。违章建筑审查的两个考量标准：是否依法申办了申办建筑用地规划许可、建设工程许可手续以及否违反城乡整体规划，均是规划部门的职权，也是规划部门的专业，而且规划部门在拆迁安置补偿中身份超然，只有这样才能做出合法的、专业的、具备可信度的认定。

根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正。

三、可以实施房屋强拆的是哪个部门

可以实施房屋强拆的部门对于违法建筑物、构筑物和设施县级以上地方人民政府责成有关部门或者乡、镇人民政府可以依法组织强拆，对于作出国有土地上房屋征收补偿决定的市、县级人民政府，经人民法院裁定准予组织强拆，依据《行政强制法第三十四条行政机关依法作出行政决定后，当事人在行政机关决定的期限内不履行义务的，具有行政强制执行权的行政机关依照本章规定强制执行。