一、保证合同无效后如何适用诉讼时效

保证合同无效的，保证人不承担保证责任。如果因此产生保证纠纷的，诉讼时效是3年，从知道权利被侵犯时开始计算。《中华人民共和国民法典》第一百八十八条【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。第六百八十一条【保证合同定义】保证合同是为保障债权的实现，保证人和债权人约定，当债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的情形时，保证人履行债务或者承担责任的合同。

二、保证人免除保证责任的情形有哪些

1、恶意串通的情形，可以免除责任。

主合同当事人双方恶意串通，骗取保证人提供保证的，保证人不承担保证责任。

2、欺诈、胁迫的情形，可以免除责任。

主合同债权人采取欺诈、胁迫等手段，使保证人在违背真实意思的情况下提供保证的，保证人不承担保证责任。

主合同债务人采取欺诈、胁迫等手段，使保证人在违背真实意思的情况下提供保证，债权人知道或者应当知道欺诈、胁迫事实的，保证人也不承担保证责任。

3、保证期间约定禁止转让的情形，可以免除责任。

保证期间，债权人依法将主债权人给第三人，而保证人与债权人事先约定仅对特定的债权人承担保证责任或者禁止债权转让的，保证人不再承担保证责任。

4、保证期间转让债务未经其同意的情形，可以免除责任。

保证期间，债权人许可债务人转让债务，但未经保证人的同意的，保证人对未经其同意转让部分的债务不再承担保证责任。

5、未经其同意变更主合同的情形，可以免除责任。

债权人与债务人协议变更主合同，但未经保证人同意，如果加重债务人债务的，保证人对加重的部分不承担保证责任。

通过上述分析知道，依据《民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。

所以保证合同无效的，保证人不承担保证责任。

如果因此产生保证纠纷的，诉讼时效是3年，从知道权利被侵犯时开始计算。