建设工程合同纠纷可以约定仲裁。根据我国仲裁法律有关规定，工程纠纷是可以约定仲裁的。只要仲裁条款有效即可适用仲裁。《中华人民共和国仲裁法》第三条下列纠纷不能仲裁:

一、经济仲裁与劳动仲裁的区别

1、适用对象不同。经济仲裁适用于平等民事主体之间的经济纠纷关系，处理的是经济合同纠纷和财产权益纠纷；劳动仲裁适用于个人与单位之间劳动关系，处理的是个人与用人单位之间在工资、劳保、辞职辞退、劳动补偿以及工伤等方面产生的劳动争议。

2、设立依据不同。经济仲裁机构是依照《仲裁法》的规定由地市人民政府组建的专门处理经济纠纷的独立部门；劳动仲裁机构是依据劳动法律、法规规定在劳动部门设立的处理劳动争议的组织。

3、立案条件不同。经济仲裁必须当事人双方在合同中订有明确具体的仲裁条款或事后已经达成仲裁协议，才能申请立案。劳动仲裁是法律规定解决劳动争议的必经程序，只要个人与用人单位签有劳动合同或者形成事实上劳动关系，发生劳动争议后就可以申请立案。

4、适用法律不同。经济仲裁是双方当事人同意就相互之间可能发生或已经发生的经济纠纷通过仲裁一裁终局法律手段解决的方式，适用的是《仲裁法》等民商事法律、法规以及国际惯例和商业规则。劳动仲裁处理的是劳动争议，适用的是《劳动法》及其相关法律法规。

5、仲裁效力不同。经济仲裁属于一裁终局，裁决一经作出即具有法律效力，除非法定原因，当事人不能再提起诉讼，仲裁裁决与人民法院判决具有同等法律效力，当事人逾期不履行，另一方当事人可以直接申请强制执行；劳动仲裁是处理劳动争议的前置程序，当事人不服劳动仲裁裁决，多数情况下可以再提起诉讼。

二、当事人申请仲裁应具备哪些条件

《仲裁法》第21条对当事人申请仲裁的条件作如下规定：

1、有仲裁协议。

仲裁协议是平等的民商事主体表示愿意将他们之间可能或已经发生的争议，提请仲裁机构进行裁决的共同意思表示的法律形式。它是仲裁机构对争议取得管辖权的依据，仲裁协议必须具备法定要件才能成立。

2、有具体的仲裁请求和事实、理由。

具体的仲裁请求指仲裁申请人请求仲裁机构所要解决的具体争议，以保护自身的合法权益。如：加工承揽合同纠纷，定作方向仲裁委员会提出仲裁申请，要求承揽方按合同中约定的质量标准提供货物。申请人中请仲裁必须以一定的事实和理由为根据。事实指引起民商事法律关系发生、变化或消灭的一切客观情况，包括事件和行为。理由是指中请人提出仲裁请求的依据，包括事实依据、法律依据、理论依据等。

应当指出的是，当事人在申请仲裁时并非就事实而言必须是确凿、真实的；理由也并非必须合理、合法。仲裁委员会受案，只要当事人提供了相关内容即可受理。

3、属于该仲裁委员会的受理范围。

《仲裁法》第2条规定：“平等主体的公民、法人和其他组织之间发生合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁”。

第3条又规定：“婚姻、收养、监护和继承纠纷以及依法应当由行政机关处理的纠纷不能仲裁。”

从以上规定看，《仲裁法》规定的仲裁范围遵守以下原则：

第一，纠纷当事人属于平等民商事法律关系主体；

第二，当事人对仲裁事项应当有处分权、和解权；

第三，仲裁的纠纷主要是合同纠纷，也包括一些非合同纠纷。