合同无效的，违约金条款也自始无效。因为违约金的有效必须以有效合同的存在为前提，当合同无效后，违约金条款因为存在基础的无效也就当然无效。一般情况下，只有合同中的争议解决条款的效力，不会受合同效力的影响，因合同无效而产生的争议，当事人之间仍然可以依照合同约定的争议解决办法予以处理。

一、建设工程施工合同无效违约条款是否有效

无效。合同无效、被撤销或者终止的，不影响合同中独立存在的有关解决争议方法的条款的效力。但是，违约金条款不属于解决争议的条款，争议解决条款是指合同中约定的，如果双方发生争议，是选择仲裁还是诉讼等条款。因此，如果合同无效，违约金条款也无效。

二、违约责任的分析

合同无效，除非合同中有合同无效，违约责任条款仍然有效的约定，否则违约条款是无效的。

根据《民法典》第一百五十七条：”民事法律行为无效、被撤销或者确定不发生效力后，行为人因该行为取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。法律另有规定的，依照其规定。“

合同无效后，可以追究违约方的过错责任。

在合同无效的情况下，有三种条款是有效的：

1、合同中独立存在的有关解决争议方法的条款；

2、因合同无效返还由该合同取得的财产；

3、有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的应当各自承担相应责任。

但违约金条款并不是结算和清算条款，结算和清算条款的意思是有关报酬、费用等方面如何计算的问题。同时，违约金条款也不是争议解决条款。争议解决条款是指合同中约定的，如果双方发生争议，是选择仲裁还是诉讼等。无效合同中关于违约金条款，是先有约定，违反约定才会适用本条款追究违约责任，现在“约定”无效了，不存在违约的情形，那么自然也就不可能适用本条款。无效合同自始无效，违约条款在无效合同中也自始无效，只能要求造成合同无效一方承担缔约过失责任或赔偿责任。