公司处理债务纠纷的方式是：

1．协商和解，债权债务当事人在自愿互谅的基础上，直接进行协商或邀请第三人从中斡旋，解决纠纷；

2．协商不成的，可向所在地的人民调解委员会提出书面调解申请；

3．调解不成的，可以提起仲裁；

4．仲裁无法解决的，可以收集相关证据向法院提起诉讼。

公司债务纠纷股东需要承担的后果

公司债务纠纷股东需要承担的后果是：补足需要预定投资的资金并承担相应的法律责或者连带的债务责任等。在有限公司中，股东一旦完成了出资义务，那么公司的债务就应当由公司独立承担，股东只以自己认缴的股份对公司承担有限责任。但在一些情况下，有限公司股东也需要对公司债务承担责任。

根据《公司法》第六十三条，一人有限责任公司的股东不能证明公司财产独立于股东自己的财产的，应当对公司债务承担连带责任。