逾期付款违约金根据是否有约定，分为不同的处理方式。一、双方对逾期付款违约金有约定：根据合同自治原则，双方当事人在合同中约定了违约金的计算方式，该约定不违反法律规定的，一般从其约定。二、当事人对逾期付款违约金没有约定的，当事人没有主张的一般不予支持。

建设工程施工合同逾期付款违约金

违约金一般等于违约所造成的实际经济损失（原先的按月补偿款构成劳动者的不当得利，应计算进用人单位实际损失，数额不应当奇大，最高不超过实际损失的120％－130％为宜）。1、合同对违约金有具体约定的按约定，对违约金无约定或约定不明确的，按没有约定处理。2、违约金的计算依据是合同总价。3、约定违约金数额一般以不超过合同未履行部分的价金总额为限。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。