《农村土地管理法》在第七章第七十七条中规定，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。

所以，对于占用了基本农田而建的养殖场，会被通知限期拆除上面的建筑物以及设施，恢复土地原状，恢复农田的基本作用。并不会有赔偿。

关于农业用地上建养殖场的问题，国土资源部明确不属于改变土地性质和用途，但在基本农田上不得建造养殖场，不能在农田保护区内建设，只能建在非保护农田上。

根据《中华人民共和国土地管理法》第十三条：农民集体所有和国家所有依法由农民集体使用的耕地、林地、草地，以及其他依法用于农业的土地，采取农村集体经济组织内部的家庭承包方式承包，不宜采取家庭承包方式的荒山、荒沟、荒丘、荒滩等，可以采取招标、拍卖、公开协商等方式承包，从事种植业、林业、畜牧业、渔业生产。家庭承包的耕地的承包期为三十年，草地的承包期为三十年至五十年，林地的承包期为三十年至七十年；耕地承包期届满后再延长三十年，草地、林地承包期届满后依法相应延长。

占用基本农田建养殖场处罚标准

非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。国家禁止任何单位和个人在基本农田保护区内建窑、建房、建坟、挖砂、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他破坏基本农田的活动。禁止任何单位和个人占用基本农田发展林果业和挖塘养鱼，基本农田只能用于粮、棉、油、蔬菜等种植业生产，而不能用于养殖业。