合同纠纷起诉协议提交的处理包括合同文本，当事人身份信息、经营资格情况工商营业执照副本，相关补充的条款、变更的条款；合同的履行情况交接的证据材料；付款方式等原始凭证及收款收据等相关的证据材料，抵押登记书面证据等。

一、合作协议书具有法律效应吗

合作协议的法律效应视情况而定，具体有：

1、双方均具有相应的民事权利能力和民事行为能力，双方意思表示真实一致，不违反强制性法律规定的合作协议有效；

2、与无民事行为能力人签署；违反法律、行政法规的强制性规定，违背公序良俗签署；恶意串通签署的合同协议无效。

一、合作合同书的要素有：

1、当事人信息。主要包括姓名，住所，联系方法等等；

2、标的。合同为何而立，标的就是关键；

3、价款。为实现标的交易而需要支付的价款，包括付款方式、条件、定金等等；

4、履行因素。包括期限、地点、方式等等；

5、违约责任。违约金、定金、赔偿金、免责等等内容；

6、解决争议的方式。明确仲裁还是诉讼。如果选择仲裁的，条款应符合仲裁法的规定；

7、合同生效条款。生效或者失效的条件以及无效的免责等等；

8、附件。记载本合同的附件种类、数量、效力等。

二、合同违约处理流程是：

1、审核合同效力。合同主体的审核，需要根据合同主体的情况确定是否主体有权签署合同，是否需要经有权主体审批后生效；合同内容的审核，需要根据合同内容确定合同内容是否违反法律强制性规定，是否侵犯其他权利主体的权利，是否超越主体权限；

2、梳理合同履行情况。根据法律规定和合同约定的内容，确定双方权利义务，核查双方履行情况；

3、审核合同违约条款。如果主张对方违约，需要核对合同约定的违约条款对这种情况约定何种救济方式，是否符合法律规定；如果对方主张我方违约，需要核查是否存在违约情况。如果存在，我方有什么正当理由可以抗辩，根据合同违约条款，我方需要承担什么违约责任；

4、确定争议解决方式。根据合同条款确定采取仲裁还是诉讼方式解决争议。以诉讼方式解决争议的，还应根据合同约定或无约定情况下实际签订地、履行地、原被告双方所在地等确定法院所在地。