房屋确权手续在房管部门办理。房屋确权指的是保障房屋所有人依照法律对自己的房屋享有占有、使用、收益、和处分的权利，它是唯一完全的物权。同时也是房地产权属登记、权属变更、转让、评估、抵押、中介服务等的产权、产籍的管理的法定依据。主要是有房管局和不动产局两个部门进行管理，其中交易监管在房管局，发证确权在不动产局。

如何办理房屋确权手续

1、申请。由权利人也就是宅基地所有人向本辖区内国土资源所提出书面申请。

2、权属审核。各地国土资源所（所提交申请的资源所或分局）进行土地登记和资料的初审，后县国土资源局审核，经审核无异议的，会以国土资源局名义发布公告，公告时间不少于7日。公告到期后，统一报请县人民政府审批。

3、注册登记。过了审批后需要填写《土地登记卡》和《共用宗土地登记卡目录》，填写《土地归户卡》，组装《土地登记簿》，并进行材料归档。

4、最后颁发证书。

《中华人民共和国城市房地产管理法》第六十条

以出让或者划拨方式取得土地使用权，应当向县级以上地方人民政府土地管理部门申请登记，经县级以上地方人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府颁发土地使用权证书。

在依法取得的房地产开发用地上建成房屋的，应当凭土地使用权证书向县级以上地方人民政府房产管理部门申请登记，由县级以上地方人民政府房产管理部门核实并颁发房屋所有权证书。

房地产转让或者变更时，应当向县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记，并凭变更后的房屋所有权证书向同级人民政府土地管理部门申请土地使用权变更登记，经同级人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府更换或者更改土地使用权证书。

法律另有规定的，依照有关法律的规定办理。