自诉案件的整个刑事诉讼程序，一般都要经过立案、侦查、审查起诉、审判和执行五个诉讼阶段；刑事自诉案件一般经过立案、审判和执行三个诉讼阶段。

1、立案

立案一般源于被害人的控告、犯罪人的自首、单位或个人的举报等。被害人到公安机关控告，若公安机关决定不立案，应通知被害人并说明理由。如果被害人对不立案的决定不服，可以申请复议也可以向人民检察院提出。人民检察院认为公安机关不立案的理由不能成立的，应当通知公安机关立案，公安机关接到通知后应当立案。

2、侦查

侦查，是指公安机关、人民检察院依法进行的专门调查工作和与案件有关的强制性措施。它是自诉案件立案后的必经程序。自诉案件只有经过侦查，才能决定是否进行起诉和审判。

3、审查起诉

人民检察院对侦查终结的自诉案件需要进行审查，决定是否将该案件提起自诉，由人民法院进行审判。犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，人民检察院应当作出起诉决定。犯罪情节显著轻微，危害不大，不认为是犯罪的；或犯罪已过追诉时效的；或经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的案件，没有告诉或撤回告诉的；或犯罪嫌疑人死亡的；或犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的；或补充侦查后仍然证据不足不符合起诉条件的，人民检察院应当作出不起诉决定。