公司内部股权变更后不能不进行工商变更登记。根据相关法律规定，股东变更登记只是为了对抗善意第三人。股权转让协议应当写明当事人的姓名或者名称、变更登记的时间、股权转让款支付的时间、方式以及争议解决方式等。

公司内部股权变更的注意事项有哪些？

1、在双方股权转让交易之中，其中股权转让的一方为纳税义务人，而受让股权的一方是扣缴义务人，履行代扣代缴税款的义务；

2、股权交易各方在签订股权转让协议并且完成股权转让的交易之后直至企业股权变更登记之前，负有纳税义务或者代扣代缴义务的转让方或者受让方，应当到有关税务机关办理纳税（扣缴）申报，并且持税务机关开具的股权转让所得缴纳个人所得税完税凭证或者免税、不征税证明，到工商行政管理部门办理股权变更登记手续；

3、股权交易各方已经签订股权转让协议的，但是未完成股权转让交易的，其企业在向工商部门申请股权变更登记手续时，应当按要求填写《个人股东变动情况报告表》并且向主管税务机关申报。如果不及时申报者将承担法律责任。

《公司法》第七十一条

有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。

股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。

经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。

第一百三十九条

记名股票，由股东以背书方式或者法律、行政法规规定的其他方式转让；转让后由公司将受让人的姓名或者名称及住所记载于股东名册。

股东大会召开前二十日内或者公司决定分配股利的基准日前五日内，不得进行前款规定的股东名册的变更登记。但是，法律对上市公司股东名册变更登记另有规定的，从其规定。