一、检察院撤销案件时对嫌疑人违法所得财产怎样处理

1、人民检察院撤销案件时，对犯罪嫌疑人的违法所得及其他涉案财产应当区分不同情形，作出相应处理：

(1)因犯罪嫌疑人死亡而撤销案件，依照刑法规定应当追缴其违法所得及其他涉案财产的，按照本规则第十二章第四节的规定办理。

(2)因其他原因撤销案件，对于查封、扣押、冻结的犯罪嫌疑人违法所得及其他涉案财产需要没收的，应当提出检察意见，移送有关主管机关处理。

(3)对于冻结的犯罪嫌疑人存款、汇款、债券、股票、基金份额等财产需要返还被害人的，可以通知金融机构、邮政部门返还被害人;对于查封、扣押的犯罪嫌疑人的违法所得及其他涉案财产需要返还被害人的，直接决定返还被害人。

2、法律依据：《人民检察院刑事诉讼规则》第二百四十八条

二、检察院立案后怎样撤案

1、如果是检察院立的案件。经审查如果符合法律的规定，属于可以不予追究刑事责任的案件，那么检察院是可以直接撤销。如果是公安局立的案件，检察院可以通过向侦办公安机关提出建议撤销意见。最终由公安机关根据相关程序撤销案件。

2、检察院在办理直接立案侦查案件过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任或有刑事诉讼法第十五条规定情形的，可以决定撤销案件。

3、《刑事诉讼法》规定，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：

(1)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;

(2)犯罪已过追诉时效期限的;

(3)经特赦令免除刑罚的;

(4)依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;

(5)犯罪嫌疑人、被告人死亡的;

(6)其他法律规定免予追究刑事责任的。