检察院不起诉，公务员一般不会被开除。

检察机关不起诉分为三种情形：

法定不起诉、酌定不起诉、存疑不起诉。

公职人员被检察机关法定不起诉或者存疑不起诉，一般都不会收到处分。

但如果是被存疑不起诉的，公职人员虽然不会被开除，但是会给予撤职处分。

《中华人民共和国政务处分法》第十四条

公职人员犯罪，有下列情形之一的，予以开除：

（一）因故意犯罪被判处管制、拘役或者有期徒刑以上刑罚（含宣告缓刑）的；

（二）因过失犯罪被判处有期徒刑，刑期超过三年的；

（三）因犯罪被单处或者并处剥夺政治权利的。

因过失犯罪被判处管制、拘役或者三年以下有期徒刑的，一般应当予以开除；

案件情况特殊，予以撤职更为适当的，可以不予开除，但是应当报请上一级机关批准。

公职人员因犯罪被单处罚金，或者犯罪情节轻微，人民检察院依法作出不起诉决定或者人民法院依法免予刑事处罚的，予以撤职；

造成不良影响的，予以开除。