根据我国法律规定，农村土地属于集体所有，村民委员会只是土地的承包权人，无权对土地进行补偿。如果需要对土地进行补偿，村民委员会应将补偿费用于土地的改良和保护。对于个人的补偿，只限于该土地上的青苗、建设项目等，这些项目属于谁投资就属于谁所有，赔偿费用也应归谁。

如果村民委员会未能就补偿问题与村民达成协议，当事人可以向法院起诉，申请执行。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，当事人必须履行发生法律效力的民事判决、裁定。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行，也可以由审判员移送执行员执行。

如果涉及继承权纠纷，当事人提起诉讼的期限为三年，自继承人知道或应当知道其权利被侵犯之日起计算。但是，自权利受到损害之日起20年以上的，人民法院不予保护。如果有特殊情况，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

因此，如果需要对土地进行补偿，应由村民委员会根据法律规定进行处理。如遇到纠纷，当事人可以依法向法院起诉，申请执行。