两者是不一样的。两者之间的区别体现在：

1．新农村合作医疗要求是农村户口，居民医疗保险要求是城镇户口；

2．新农合可报销的医药目录比城镇医保少，新农合在乡镇医院报销比例高，在市级医院平均报销比例比城镇医保低百分之一二十，最高封顶也比城镇医保少。

跨省医保报销比例

报销比例门槛费以上至3000元报88％，3000－5000元报90％，5000－10000元报92％，10000元以上至最高支付限额内的报95％，其中乙类药品按80％，贵重药品按70％，特殊检查和特殊治疗的按70％报销。

《中华人民共和国社会保险法》第三十条下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：

（一）应当从工伤保险基金中支付的；

（二）应当由第三人负担的；

（三）应当由公共卫生负担的；

（四）在境外就医的。

医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。