外商投资企业法律制度和公司法的主要区别分述如下：

(1)《公司法》对股东的出资比例未作规定，而《中外合资经营企业法》规定外国合营者的投资比例一般不得低于25%;

(2)《公司法》规定公司注册资本的最低限额，而三个涉外企业法对此未作明确规定，适用于我国《公司法》关于注册资本的最低限额的规定;

(3)《公司法》规定有限责任公司股东向股东以外的人转让出资时，应当经其他股东过半数同意，而《中外合资经营企业法》及其实施条例规定，合营一方向第三者转让出资，须经合营他方同意，董事会讨论通过，并经审批机构批准;

(4)《公司法》规定，公司应设股东会、董事会或执行董事和监事会或监事，还规定了有限责任公司董事会的产生和人数限额。而中外合资经营企业和中外合作经营企业可以不设股东会和监事会，董事由各方推荐，董事人数由各方协商确定，公司的重大问题都由董事会确定;外商投资企业的内部组织机构，由外商自定。