人民检察院是我国非常重要的司法机关，人民检察院对一些特定的案件是具有直接侦查权力的，人民检察院出会对公安机关移送的案件进行审查，确定是否提起公诉，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。

检察院对案件进行审查后，在证据不足的情况下作出不起诉决定的，依据具体的案件可以作出以下的处理：

1、如果是公安机关移送的案件，公安机关认为检察机关不起诉决定有错误的，是可以申请复议的，如果检察机关复议后仍然不起诉的，公安机关可以在收到复议决定书后，连同相关的材料向上级检察机关申请复核。

2、如果公安机关认同检察机关不起诉决定的，犯罪嫌疑人被公安机关采取强制措施的，公安机关应该立即解除刑事强制措施，释放在押的当事人。

3、公安机关收到不起诉决定后，公安机关认为要追究刑事责任的，是可以继续对案件进行侦查的，在收集到新证据的情况下，可以再将案件材料移送到检察机关，请求检察机关提起公诉。

通过上述的分析，检察机关在证据不足的情况下，是可以作出不起诉决定的，如果公安机关或者案件的被害人对不起诉决定不服的，是可以申请复议或者复核的，而公安机关可以进行补充的侦查。