可以，招标代理企业为一般纳税人提供招标代理服务收取费用,可以开具增值税专用发票。

一、中标后不交中标服务费

中标服务费不交的后果他自愿放弃了中标或者投标。对他不产生法律效力。①招标代理机构从事招标代理业务，应当收取中标服务费，以支持企业经营。招标人一般没有必要收取中标服务费，因为是自己给自己采购、使用自己的资金。②收取中标服务费必须在招标文件中明确，作为投标人的投标成本组成部分。如果未在招标文件中明确，投标人不会考虑这一部分费用。③扣取投标保证金作为质保金的话，同样需要在招标文件中明确，否则中标人可以不答应。确实没有在招标文件中明确的，可以与中标人协商。④招标文件中一般规定招标结束后，就将投标保证金退还给投标人。

二、一般纳税人哪些情况下可以开具3% 增值税专用发票

一般纳税人可以开具3%专用发票。一般纳税人开的专用发票的税率是3%，是因为该一般纳税人按照相关规定部分项目可选择简易计税办法，依照3%的征收率计算交纳增值税，不得抵扣进项税额，但可自行开具增值税专用发票。除以下情形之外，按简易办法征税的均能开具增值税专用发票：（1）属于增值税一般纳税人的单采血浆站销售非临床用人体血液，可以按照简易办法依照3%征收率计算应纳税额，但不得对外开具增值税专用发票；（2）纳税人销售旧货，应开具普通发票，不得自行开具或者由税务机关代开增值税专用发票。（3）销售自己使用过的固定资产，减按2%征税的。

三、没有登记公司，注册公司后可以开发票吗

任何经营单位，包括一般纳税人和小规模纳税人，都可以向税务部门申请，购买和使用一般发票。根据税法规定，接受增值税发票的单位，必须是一般纳税人，因为一般纳税人可以抵扣进项税额；普通发票只能开给小规模纳税人，因为增值税的征收是定率征收的（加工制造企业为6%，商品流通企业为4%），税法规定不准给小规模纳税人开具增值税专用发票。