户籍转移时新农村合作医疗并不会一并转移。

户籍转移手续由公安机关操作、处理，只是针对当时人户籍关系的转移；新农村合作医疗是在当地社保机构的参保，公安机关的户籍管理并不直接掌握这一信息，且不属于其业务范围。因此新农村合作医疗并不会随同当事人户籍关系的转移而转移，需要时当事人应到当地社保机构办理转移手续。

户口迁移，医保社保要怎么迁移

1、该项当事人应带上本人的有效身份证、户口本、社保卡，去户口迁入地的社保部门开具社保（包括医保）关系接收函；

2、再带上该接收函及当事人的上述证件，去户口迁出地的社保部门开具社保转移证明（该证明3个月以内有效）和身份证复印件1张（在同一张A4纸上复印正面和背面）；

3、然后去当事人户口迁入地的社保部门，交验该转接证明及本人的身份证、户口本、社保卡后，申请办理社保（包括医保）续缴即可；

4、当事人可以事先咨询户口迁入（出）地的社保部门工作人员，并根据对方的提示办理相关手续即可。

《中华人民共和国社会保险法》

第二条国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。

第四条中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。

个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。