（1）适用税率不同。小规模纳税人适用3％征收率，而一般纳税人则适用13％、9％、6％、0几档税率。

（2）发票使用权限不同。小规模纳税人不能自行开具增值税专用发票，如遇特殊情况，只能申请由税务机关代开；而一般纳税人则可以自行开具增值税专用发票。

（3）记账报税要求不同。小规模纳税人应交税金计算是按照销售额乘以增值税税率计算，而一般纳税人则是按照销项税额和进项税额的差额纳税。

（4）申报周期不同。小规模纳税人可自行选择以月度或季度为纳税周期来申报纳税，而一般纳税人通常是以月度为单位来进行纳税申报。

一、小规模纳税人和一般纳税人如何选择

（1）如果公司投资规模较大，并且年收入颇丰，有可能在短时期内超过500万元的判定标准，就可以直接申请认定为一般纳税人。

（2）如果企业未来合作方为大客户，那么对方在交易往来过程中，基本都会要求企业开具增值税专用发票，建议企业最好选择成为一般纳税人，否则，可选择成为小规模纳税人。

（3）对于税率为13％，且为轻资产的行业来说，其增值税税负一般较高。固在此种情况下，企业可选择申请成为小规模纳税人。

（4）如果创业者注册的公司成本费用构成能够取得增值税专用发票的占比比较高，进项税额抵扣充分。而且通过实际测算，它的增值税税负低于3％，这时便可以选择认定一般纳税人。

二、小规模纳税人和一般纳税人的定义

小规模纳税人是指年销售额在规定标准以下（即小于等于500万元），并且会计核算不健全（即不能正确核算增值税的销项税额、进项税额和应纳税额），不能按规定报送有关税务资料的增值税纳税人。

一般纳税人是指年应征增值税销售额超过财政部规定的小规模纳税人标准的企业和企业性单位，其特点是增值税进项税额可以抵扣销项税额。