农村征地补偿纠纷的主要原因有：

1、农村土地征收补偿费用的性质和归属法律规定不明确；

2、国家农村土地征收补偿标准不合理；

3、补偿程序不完善，司法救济难到位。

一、征收土地是否也被强制拆迁的

土地征收过程中，已经全额支付了征收补偿款，一般可以强制拆迁。《土地管理法实施条例》第二十五条第三款规定，市、县人民政府土地行政主管部门根据经批准的土地征收方案征收土地，会同有关部门拟订征地补偿、安置方案，在被征收土地所在地的乡（镇）、村予以公告，听取被征收土地的农村集体经济组织和农民的意见。征地补偿、安置方案报市、县人民政府批准后，由市、县人民政府土地行政主管部门组织实施。对补偿标准有争议的，由县级以上地方人民政府协调；协调不成的，由批准征收土地的人民政府裁决。征地补偿、安置争议不影响征收土地方案的实施。

二、土地确权后征用补偿款拆迁归谁

土地确权后被征用补偿款归属需要分情况讨论：①土地征收后的土地补偿款归土地所有人所有。即征收农村土地的，土地补偿款归村集体所有。②对于土地征收中青苗补偿费、地上附着物补偿费等，归青苗或者地上附着物的所有人享有。③对于土地征收中的安置补助费，由享有安置权利的村民享有，直接发放到村民手中。

三、搬迁补偿款的发放是如何规定

搬迁补偿款的发放流程如下：

被拆迁人在与拆迁人签订拆迁补偿协议时，就应将补偿金额、付款方式、付款期限等作明确约定，届时拆迁人应当在该协议约定的付款期限内；

将拆迁补偿款存入指定银行，并将银行开具的补偿款存款单据交付给被拆迁人。

农村土地征收启动到发放补偿款的全流程：征地告知书-征地公告-补偿登记-拟征地补偿安置方案-补偿安置方案-听证-审批通过补偿安置方案-支付补偿款。

城市房屋拆迁启动到发放补偿款的全流程：征收调查登记-房屋征收决定-征收补偿方案（公布）-房屋征收公告--签订补偿协议-房屋征收补偿决定-支付-搬迁。