原劳动部《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》(劳部发〔1994〕481号)第3条规定，企业克扣或者无故拖欠劳动者工资的，以及拒不支付延长工作时间工资报酬的，除在规定的时间支付劳动者工资报酬外，还需加发相当于工资报酬25%的经济补偿金。《劳动合同法》第85条规定，企业违反工资支付义务，包括未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬，以低于当地最低工资标准支付劳动者的工资或安排加班不支付加班费的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费;劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分;逾期不支付的，责令企业按应付金额的50%-100%的标准向劳动者加付赔偿金。根据上述规定，如果企业违反了工资支付义务，除了要支付或补足劳动报酬之外，还有可能承担对劳动者民事赔偿责任，可见企业的违规成本是比较高的。依据《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。依据《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》第三条，用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，以及拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的，除在规定的时间内全额支付劳动者工资报酬外，还需加发相当于工资报酬百分之二十五的经济补偿金。所以如果公司长期扣押工资不发给员工可以要求让公司立即支付拖欠的工资并支付相当于拖欠工资总额百分之二十五的经济补偿金。如果单位拒绝，可以依据《劳动法》第七十七条、第七十九条、第八十二条、第八十三条规定，自劳动争议发生之日起六十日内向劳动争议仲裁委员会提出书面申请。要求公司满足员工要求，仲裁裁决一般应在收到仲裁申请的六十日内作出。对仲裁裁决无异议的，当事人必须履行。对仲裁裁决不服的，可以自收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。如果即不在十五日内向人民法院提起诉讼，又不履行的，可以向法院申请强制执行。劳动争议发生之日也就是单位员工要求之日分公司是没有法人资格的，有些分公司尽管没有法人资格也可以在其所在地劳动局申请仲裁，有些分公司因为没有法人资格的要到其总公司注册地的劳动局申请仲裁。
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1、用人单位不得克扣劳动者工资。 有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资： (1)用人单位代扣代缴的个人所得税； (2)用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用； (3)法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费； (4)法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。 2、因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。 但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
公司不能克扣员工工资。但是用人单位可以代扣劳动者工资，如：用人单位代扣代缴的个人所得税；用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用等。
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