一般扣工资会有下面三个情况： 1、出勤天数未达到合同约定的天数，这个要按照基本工资除以应出勤天数再乘以请假天数，得出应扣除的工资； 2、工作期间违反公司规章制度或其他惩罚条例（比如打架、旷工、质量事故等），具体的金额根据公司的规定执行； 3、绩效扣分，一般公司的工资体系里会有绩效工资，也就是拿出一部分工资，根据绩效评价来发放，只有达到满分才能全部拿到，这个具体要参考公司的绩效体系是怎么构筑的； 若企业扣工资没有合法合理的理由，劳动者可以向劳动监察部门投诉，获得自己应得的工资。
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公司章程违反公司法不能成立。公司章程的条款不得与公司法的强制性规定相冲突，一旦公司章程与公司法的强制性规定有冲突时，将会导致依据该部分公司章程做出的决议无效，因而公司在制定公司章程时不仅要灵活机动，因地制宜，更要确保不违反公司法的强制性规定。
只要员工和公司有劳动关系，没有任何理由可以不发员工工资，即便是员工造成了单位损失，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。 经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
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