食用农产品质量安全风险监测和风险评估由县级以上人民政府农业行政部门依照《中华人民共和国农产品质量安全法》的规定进行。国境口岸食品的监督管理由出入境检验检疫机构依照食品安全法和本条例以及有关法律、行政法规的规定实施。食品药品监督管理部门对声称具有特定保健功能的食品实行严格监管，具体办法由国务院另行制定。
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食品安全监管分为3个层级。 首先，国务院设立食品安全委员会。 其次，国务院卫生行政部门承担食品安全综合协调职责，负责食品安全风险评估、食品安全标准制定、食品安全信息公布、食品检验机构的资质认定条件和检验规范的制定，组织查处食品安全重大事故； 国务院质量监督、工商行政管理和国家食品药品监督管理部门依照食品安全法和国务院规定的职责，分别对食品生产、食品流通、餐饮服务活动实施监督管理。 再其次，县级以上地方人民政府统一负责、领导、组织、协调本行政区域的食品安全监督管理工作，建立健全食品安全全程监督管理的工作机制； 统一领导、指挥食品安全突发事件应对工作；完善、落实食品安全监督管理责任制，对食品安全监督管理部门进行评议、考核。
根据食品安全法的规定，食品药品监督管理部门负责对餐饮服务环节进行监管。具体职责包括：负责颁发餐饮服务许可。对申请从事餐饮服务活动的单位或者个人，依据食品安全法规定的条件进行许可。具体是按照食品安全法第二十七条第一项至第四项规定的要求，对拟从事的餐饮服务的申请人的条件进行审查。包括：一是是否具有与拟从事的餐饮服务规模相适应的店面、食品加工、储存等场所，并与有毒、有害场所及其他污染源保持规定的距离；二是是否具有与经营的餐饮服务规模相适应的消毒、更衣、盥洗、采光、照明、通风、防腐、防尘、防蝇、防鼠、防虫、洗涤以及处理废水、存放垃圾和废弃物的设备或者设施；三是是否具备有合理的餐饮服务设备布局，防止待加工食品与直接入口食品、原料与成品交叉污染，避免食品接触有毒物、不洁物。
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