基本医疗保险统筹基金支付的住院和门诊大病医疗费用设立起付标准。一、二、三级定点医疗机构起付标准分别为200元、500元、800元，社区定点医疗机构起付标准按照一级定点医疗机构执行。参保人住院治疗，在一个年度内第一次住院的，起付标准按照100%执行;第二次住院的，起付标准按照50%执行;第三次及以上住院的，起付标准统一按照100元执行。参保人门诊大病治疗，在一个年度内负担一个起付标准。尿毒症透析治疗、器官移植、恶性肿瘤、精神病等门诊大病参保人个人负担的起付标准可以适当减免。
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为方便城乡居民出院实现基本医保、大病保险、医疗救助之间的衔接，《实施方案》中明确规定，城乡居民在信息化互联互通并能够开展即时结报的医疗机构就医。 入院时将参保证明、身份证明、最低生活保障证、特困人员供养证、“一卡通”、银行账户等一并交医院，在一次或多次住院后自负费用若未达到5000元大病保险起付线时，按照“基本医保、医疗救助”流程依次进行“一站式服务”； 单次住院合规的个人自负费用超过起付标准的部分，承办商业保险机构及时给予补偿大病医疗保险费用； 单次住院合规的自负费用未超过起付线，但年内经多次住院且累计超过起付标准的部分，承保机构在结算年度末给予一次性补偿，按照“基本医保、大病保险、医疗救助”流程依次进行“一站式服务”。
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