(一)门诊报销 (1)普通门诊报销比例50%，每人每年报销封顶80元; (2)门诊观察每日最多可报销30元，每年最多可报销1000元; (3)门诊大病报销比例50%，肝硬化、脑血栓及脑溢血后遗症、类风湿性关节炎(活动期)、股骨头坏死、合并并发症的高血压、糖尿病、肺心病、系统性红斑狼疮、再生障碍性贫血、器官或组织移植抗排异治疗、白血病、重性精神疾病、先天性肾上腺皮质增生症、先天性甲状腺功能低下患者每人每年报销封顶线1万元;恶性肿瘤、尿毒症、血友病患者每人每年报销封顶线3万元。 (二)住院报销 (1)乡镇级(一级)住院报销起付线200元，报销比例85%。 (2)县级(二级)定点医疗机构住院报销起付线500元，报销比例70%。 (3)市级(三级)定点医疗机构住院报销起付线700元，报销比例55%。 (4)省级(三级)定点医疗机构住院报销起付线1000元，报销比例50%。 (5)经县级新农合管理机构同意转诊备案，并在县域外除市级、省级定点的医疗机构住院的，统一报销起付线1000元，报销比例40%，保底报销比例20%。 (6)基本药物目录内药品、中药饮片及中医针灸、推拿、拔罐、刮痧等非药物非手术疗法补偿比例在原报销比例基础上提高10%。德州市市级、县级中医院、妇幼保健院起付线降低200元，补偿比例在原报销比例基础上提高5%。 (7)儿童白血病、儿童先天性**病、终末期肾病、乳腺癌、宫颈癌、重性精神疾病、艾滋病机会性感染、耐多药肺结核、血友病、慢性粒细胞白血病、唇腭裂、肺癌、食道癌、胃癌、I型糖尿病、甲亢、急性心肌梗塞、脑梗死、结肠癌、直肠癌等20种重大疾病在市、省级定点医疗机构住院费用新农合报销比例70%。 (8)自身原因导致的意外伤害，除《山东省新型农村合作医疗诊疗项目目录》规定不予报销的情形项目外，统一住院报销起付线1000元，报销比例执行分段原则，参合人员在16周岁(含16周岁)至60周岁之间的，报销比例20%;低于16周岁、高于60周岁(含60周岁)的，报销比例30%。 (9)参合孕产妇住院自然分娩、剖宫产统一实行定额补偿，自然分娩补偿500元，剖宫产补偿1000元。 (10)参合人员在同一参合周期、同一医疗机构多次住院的，首次扣除起付线，再次住院起扣除起付线的50%。 参合农民每人每年门诊、住院累计报销封顶线20万元。
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北京市在职职工医院门诊报销比例达到70%以上，退休人员达到85%以上，社区卫生机构报销比例均为90%，有门诊封顶线可查询。北京市在职职工住院报销比例在85%以上，退休人员住院报销比例在90%以上，最高可达99.1%，有住院封顶线可查询。
一般情况下，门诊的报销比例在50%以下，统筹基金支付的部分较少，大部分是由参保人的个人账户资金或者是现金支付。住院和大病部分的报销比例大约在70%-80%左右浮动，根据参保人的连续缴费年限长短略有浮动，缴费年限越长，报销比例和支付限额越高。如果参保人没有到指定医疗机构就医，那么不管是门诊费用还是其他费用，都必须自行承担，无法报销。
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