分公司分为两类 一、分公司非独立核算的，非独立核算指的是分公司不能单独开立基本账户，不能单独领用发票，可以在总公司下设单独账户，统一纳税。 二、分公司独立核算的，独立核算是指对本单位的业务经营活动过程及其成果进行全面、系统的会计核算。 分公司不属于独立核算的纳税人，财务并入总公司统一核算管理，是否要建立有关辅助帐、明细帐，可由总公司确定。分公司与总公司经营的业务相同，分公司实行报帐制度，在所属地办理相关证照。 国税这块，经总公司主管税务机关同意后，分公司实行增值税预征，然后由总公司统一抵扣；营业税按公司所属地分别缴纳。 非独立核算单位的特点是：一般由上级拔给一定数额的周转金，从事业务活动，一切收入全面上缴，所有支出向上级报销，本身不单独计算盈亏，只记录和计算几个主要指标，进行简易核算。根据《中华人民共和国税收征收管理法》第15条、19条的规定，企业和企业在外地设立的分支机构属于从事生产经营的纳税人，按照法律、行政法规和国务院财政、税务主管部门的规定设置账簿。 非独立核算又称报帐制，是把本单位的业务经营活动有关的日常业务资料，逐日或定期报送上级单位，由上级单位进行核算。 税务登记表中的核算方式是指纳税人的财务会计核算方式。独立核算是指对本单位的业务经营活动过程及其成果进行全面、系统的会计核算。独立核算单位的特点是：在管理上有独立的组织形式，具有一定数量的资金，在当地银行开户；独立进行经营活动，能同其他单位订立经济合同；独立计算盈亏，单独设置会计机构并配备会计人员，并有完整的会计工作组织体系。
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分公司可以独立对外开发票。凡缴纳营业税的纳税人在办理完税务登记的同时到当地主管地税机关发票销售窗口，领取发票领购簿按照经营项目购买发票。分公司可以独体对外签合同并开出相应的发票，但必须取得营业执照以及税务登记证。分公司在进行了税务登记后，可以向税务局申领发票。
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